結(jié)構(gòu)層和防水層即使保持原有做法，但一般還要在預(yù)制空心板上卷材防水層，因此仍不可避免在女兒墻和天溝沿口等薄弱環(huán)節(jié)處出現(xiàn)滲漏。特別是剛性防水屋面，最嚴(yán)重的問(wèn)題是防水層在施工完成后可能會(huì)出現(xiàn)裂縫而漏水。產(chǎn)生裂縫的原因很多：氣候變化及太陽(yáng)照射引起的屋面熱脹冷縮；屋面板受力后的翹曲變形；地基沉降或墻體承重后坐漿收縮等原因引起的屋面變動(dòng)；屋面板除變或材料干縮變形等。

屋頂上建造屋頂花園尚且可能漏水，而在較容易出現(xiàn)漏水的屋頂防水層上進(jìn)行多項(xiàng)園林工程施工，這就更容易造成屋頂防水層破壞而導(dǎo)致漏水。即使不打洞穿孔或埋設(shè)固定鐵件，如不精心施工，仍會(huì)破壞屋頂防水和排水構(gòu)造，造成屋頂漏水。進(jìn)行栽植有時(shí)也會(huì)破壞防水層，比如填土?xí)r用的鏟子有可能會(huì)破壞防水層。

各種植物的澆灌用水、水池、噴泉等水體用水也極為頻繁，使屋頂又增加了產(chǎn)生漏水的水源。一般建筑物屋頂?shù)呐潘到y(tǒng)，均未考慮建造屋頂花園所需的種植物滲漏水和水體工程的排水問(wèn)題，特別是澆灌水和水池污水中含有植物根葉和泥沙等雜務(wù)，會(huì)使排水口及管道堵塞，造成屋頂積水和漏水。

不論是何種因素造成漏水，人們往往歸罪于屋頂花園，這就為屋頂花園的推廣造成了社會(huì)阻力。因此規(guī)劃設(shè)計(jì)和施工單位以及使用單位均應(yīng)有足夠的認(rèn)識(shí)共同處理好屋頂花園的防水問(wèn)題。